1.东海篇（東の海イーストブルー編，收录卷数：第1—12卷，收录话数：第1—100话，动画集数：第1—61集） 蒙奇·D·路飞童年时受到海贼“红发”杰克斯的启蒙，自小就立志要成为“海贼王”。路飞17岁时出海之后，接续遇见海贼猎人罗罗亚·佐罗、狙击手撒谎布、航海士奈美、厨师文斯莫克·山智并结为伙伴。他们组成草帽海贼团准备进入伟大的航道来到罗格镇。离开罗格镇后，路飞一行人在伟大航道的入口“颠倒山”之前以各自的梦想立誓，跨越颠倒山之后进入伟大航道，展开下一段冒险。

2.阿拉巴斯坦篇（アラバスタ編，收录卷数：第12—24卷，收录话数：第101—217话，动画集数：第62—130集） 草帽海贼团一行人来到伟大航道、在威士忌山峰遇到卧底在秘密犯罪组织巴洛克华克的阿拉巴斯坦王国公主奈菲特·薇薇，从公主口中得知阿拉巴斯坦正处于水深火热之中，以及王下七武海‘Mr.0’鳄鱼的阴谋后，路飞决定帮助薇薇。他们在途中前往岛屿“小花园”与巴洛克华克的部分成员开战，并在旅途中为了治好在小花园生病的奈美去了磁鼓岛并增添一名船医伙伴多尼多尼·乔巴。 抵达阿拉巴斯坦后，当地因为鳄鱼的煽动爆发内战，路飞最后击败鳄鱼，内战亦随之结束。其后薇薇向路飞等人道别，而原巴洛克华克副社长妮古·罗宾因失去人生目标，以考古学家的身份加入草帽海贼团。

3.空岛篇（空島編，收录卷数：第24—32卷，收录话数：第217—303话，动画集数：第144—195集） 离开阿拉巴斯坦王国之后，草帽海贼团撞见一艘从天而降的大船，同时纪录指针竟然向上指向天空。对空岛产生兴趣的路飞靠着上升海流前往空岛。误入空岛统治者“神”艾尼路的领地，因此草帽海贼团、神的军团、以及领地原住民“香狄亚”展开激战，艾尼路最终被路飞击败，而空岛居民和香狄亚一族长达四百年的战争也终止。

4.水之七岛篇（ウォーターセブン編，收录卷数：第34—39卷，收录话数：第322—374话，动画集数：第229—263集） 为修缮伤痕累累的前进梅利号，草帽海贼团来到以造船业闻名的水之七岛，却得知梅莉号已经无法修复的消息，撒谎布又惨败给拆船流氓弗兰奇。另一方面，罗宾遇见政府机关CP9，由于害怕过去发生在自己故乡的悲剧在草帽海贼团上重演，因此自愿被CP9给带走。而撒谎布又因不满路飞报废梅利号的决定而决定离开，草帽海贼团陷入分崩离析的危机。

5.艾尼爱斯大厅篇（エニエス・ロビー編，收录卷数：第39—46卷，收录话数：第375—441话，动画集数：第264—325集） 草帽海贼团前往司法岛救回罗宾，与世界政府底下的CP9部队全面对决，最后救回罗宾，撒谎布也回到团里。路飞等人以火葬仪式为大限已至的梅利号送行，而弗兰奇用当初偷来的二亿贝里建造一艘新船千里阳光号继续出海冒险，而弗兰奇也以船匠的身份加入海贼团。

6.恐怖三桅帆船篇（スリラーバーク編，收录卷数：第46—50卷，收录话数：第442—490话，动画集数：第337—381集） 草帽海贼团踏入魔幻的三桅帆船地带，遇见神秘的骷髅人布鲁克，并进入王下七武海月光·摩利亚所布下的陷阱。最后路飞击败了摩利亚，布鲁克也以音乐家的身份加入草帽海贼团。

7.香波地诸岛篇（シャボンディ諸島編，收录卷数：第50—53卷，收录话数：第491—513话，动画集数：第385—405集） 草帽海贼团进入伟大航道前半段的最末端香波地诸岛却和世界贵族天龙人起些冲突，之后他们遇到海军大将黄猿、战桃丸以及和平主义者的围捕，最后巴索罗谬·大熊利用果实能力帮助草帽海贼团逃脱把各个船员传送至不同岛屿。

8.女人岛亚马逊百合篇（女ヶ島アマゾン・リリー編，收录卷数：第53—54卷；收录话数，第514—524话，动画集数：第408—421集） 被击飞至亚马逊百合的路飞遇见王下七武海的“海贼女帝”波尔·汉库珂，被女帝俘虏后又释放，得知自己的兄长“火拳”波特夹斯·D·艾斯要被处决的消息，便请汉库珂将自己偷渡至海底大监狱“因佩尔”救回兄长艾斯。

9.大监狱因佩尔篇（大監獄インペルダウン編，收录卷数：第54—56卷，收录话数：第525—549话，动画集数：第422—458集） 路飞在因佩尔遇见过去的敌人(“小丑”巴奇、以及前巴洛克华克的四位成员)及王下七武海的“海侠”甚平，众人为达成各自目的分别先后集结组成联盟后展开越狱行动，最后路飞来到处刑的场所海军本部马林梵多。

10.马林梵多顶点战争篇（マリンフォード頂上戦争編，收录卷数：第56—61卷，收录话数：第550—597话，动画集数：第459—516集） 路飞及越狱同伴、白胡子海贼团、海军、王下七武海等多方势力展开了“顶点战争”。战争最后由“红发”杰克斯出面调停而收场，但遗憾的是艾斯和白胡子皆殒命于战场。痛失哥哥艾斯并深感自身实力需要变得更强的路飞在战争结束后，他在“冥王”雷利的建议下给伙伴留下讯息，各自展开为期两年的修行之旅。